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Enregistrement W1837473895 · doi:10.1039/c5ob00962f

Investigation of the active turn geometry for the labour delaying activity of indolizidinone and azapeptide modulators of the prostaglandin F<sub>2α</sub> receptor

2015· article· en· W1837473895 sur OpenAlexafffund
Meriem K. Boukanoun, Xin Hou, Ljiljana Nikolajev, Sara Ratni, David M. Olson, Audrey Claing, Stéphane A. Laporte, Sylvain Chemtob, William D. Lubell

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePreterm Birth and Chorioamnionitis
Établissements canadiensHEC MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversity of AlbertaMcGill University Health CentreUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de MontréalCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaMarch of Dimes Canada
Mots-clésProlineChemistryReceptorAllosteric regulationTurn (biochemistry)StimulationStereochemistryAmino acidProstaglandinInternal medicineBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

On pursuing molecules that delay labour, so-called tocolytics, the prostaglandin F2α receptor (FP) was targeted, because of its role in the stimulation of uterine contractions leading to birth and preterm birth. Previously, both the indolizidinone PDC-113.824 (5) and the aza-glycinyl-proline analog 6 were shown to delay labour in mice by modulating the FP function, likely by an allosteric mechanism, which features biased signalling. The crystal structure and computational analyses of the indolizidin-2-one amino acid and aza-glycinyl-proline components of 5 and 6 in model peptides have shown them to adopt a geometry that mimics ideal type I and II'β-turns. To elucidate the precise turn geometry for receptor recognition, analogs 1-4 have now been synthesized: macrocycle and pyrroloazepinone mimics 1 and 2 to mimic type I, and glycinyl-proline and d-alaninyl-proline analogs 3 and 4 to favour type II'β-turn geometry. Notably, transannular cyclization of peptide macrocycle 13 has provided diastereoselectively pyrroloazepinone 15 by a novel route that provides effective access to mimics 1 and 2 by way of a common intermediate. Among the four analogs, none exhibited efficacy nor potency on par with 5 and 6; however, d-alaninyl-proline analog 4 proved superior to the other analogs in reducing PGF2α-induced myometrial contractions and inhibiting FP modulation of cell ruffling, a response dependent on the Gα12/RhoA/ROCK signaling pathway. Furthermore Gly-Pro analog 3 potentiated the effect of PGF2α on Gαq mediated ERK1/2 activation. Evidence that 4 adopted turn geometry was obtained by conformational analysis using NMR spectroscopy to characterize respectively the influence of solvent and temperature on the chemical shifts of the amide NH protons. Although mimicry of the type II' geometry by 3, 4, 5 and 6 may favour activity, distortion from ideal geometry by the indolizidinone and aza-glycinyl residues of the latter appears to enhance their biological effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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