A reinvestigation of the lipopolysaccharide structure of <i>Helicobacter pylori</i> strain Sydney (SS1)
Notice bibliographique
Résumé
In this study, we describe a reinvestigation of the lipopolysaccharide (LPS) structure of Helicobacter pylori strain Sydney (SS1) based on the NMR analysis of oligosaccharides obtained through the use of various degradations of the LPS as well as capillary electrophoresis-MS data. The results of the analysis indicated that the core region of a major H. pylori SS1 LPS glycoform consists of a backbone core oligosaccharide substituted at the D-glycero-D-manno-heptose (DD-Hep) residue by a linear chain composed of a trisaccharide fragment α-ddHep-3-α-L-Fuc-3-β-GlcNAc, as previously demonstrated for H. pylori strain 26695, further elongated by consecutively added α-Glc and β-Gal residues, and terminating in a novel linear chain consisting of 1,2-linked β-ribofuranosyl residues, where the last β-ribofuranosyl residue provides a point of attachment for the O-chain polysaccharide: [Formula: see text] where [2-β-Ribf-](n) is a short (three to five residues) oligomer of 1,2-linked β-ribofuranose (riban), and PS is a polysaccharide chain consisting of N-acetyllactosamine, substituted with α-Fuc to form Lewis (Le)-type structures. In addition to the previously identified LacNAc, Le(y) and Le(x) components, the O-chain polysaccharide of H. pylori SS1 LPS was found to contain a novel LacNAc unit carrying a phosphoethanolamine substituent at the O-6 position of β-GlcNAc residues.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».