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Enregistrement W1838840306

Double Heterozygosity of BRCA2 and STK11 in Familial Breast Cancer Detected by Exome Sequencing.

2015· article· en· W1838840306 sur OpenAlexaff
Mojgan Ataei-Kachouei, Javad Nadaf, Mohammad Taghi Akbari, Morteza Atri, Jacek Majewski, Yasser Riazalhosseini, Masoud Garshasbi

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMcGill UniversityMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneticsExome sequencingSTK11Breast cancerSanger sequencingBiologyBRCA2 ProteinPenetranceLoss of heterozygosityExomeGermline mutationMassive parallel sequencingMissense mutationMutationCancerGeneDNA sequencingAllelePhenotypeKRAS
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Germ-line mutations of BRCA1 and BRCA2 genes are responsible for approximately 25-30% of dominantly inherited familial breast cancers; still a big part of genetic component is unknown. The aim of this study was to investigate genetic causes of familial breast cancer in a pedigree with recessive pattern of inheritance. METHODS: We applied exome sequencing as a useful approach in heterogeneous diseases gene identification in present study for familial breast cancer. Sanger sequencing was applied for validation and segregation analysis of mutations. RESULTS: Here, we describe a family with three affected sisters of early-onset invasive ductal carcinoma due to heterozygous frame shift mutation rs80359352 in BRCA2 gene as the first report in Iranian patients in association with a novel missense SNP of STK11 (p.S422G). These mutations are inherited from their normal father. CONCLUSION: Despite apparent recessive pattern of inheritance a dominant gene (here BRCA2) can be involved in pathogenesis of hereditary breast cancer which can be explained by incomplete penetrance of BRCA2 mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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