The contribution of XRCC6/Ku70 to hepatocellular carcinoma in Taiwan.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) is a neoplasm for which the prevalence and mortality rates are very high in Taiwan. The DNA non-homologous end-joining repair gene XRCC6/Ku70 plays an important role in the repair of DNA double-strand breaks (DSBs) induced by both exogenous and endogenous DNA-damaging agents. Defects in overall DSB repair capacity can lead to genomic instability and carcinogenesis. In this study, we investigated the contribution of variant XRCC6 in relation to the risk of HCC, from the levels of DNA, RNA and protein. MATERIALS AND METHODS: In this hospital-based case-control study, we collected 298 patients with HCC and 298 cancer-free controls, with frequency matched by age and gender. Firstly, the associations of XRCC6 promoter T-991C (rs5751129), promoter G-57C (rs2267437), promoter A-31G (rs132770), and intron-3 (rs132774) polymorphisms with HCC risk in this Taiwanese population were evaluated. Secondly, 30 HCC tissue samples with variant genotypes were tested to estimate the XRCC6 mRNA expression by real-time quantitative reverse transcription. Finally, the HCC tissue samples of variant genotypes were examined by immunohistochemistry and western blotting to estimate their XRCC6 protein expression levels. RESULTS: Compared with the TT genotype, the TC and CC genotypes conferred a significantly increased risk of HCC [adjusted odds ratio (aOR)=2.43 and 3.52, 95% confidence interval (CI)=1.52-4.03 and 1.18-13.36, p=0.0003 and 0.0385, respectively]. The mRNA and protein expression levels in HCC tissues revealed statistically significantly lower XRCC6 mRNA and protein expressions in the HCC samples with TC/CC genotypes compared with those with the TT genotype (p=0.0037 and 0.0003, respectively). CONCLUSION: Our multi-approach findings at the DNA, RNA and protein levels suggested that XRCC6 may play an important role in HCC carcinogenesis in the Taiwanese population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».