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Enregistrement W1840932698 · doi:10.4141/cjps2013-166

Populations, diversity and identities of bacterial endophytes in potato (<i>Solanum tuberosum</i> L.) cropping systems

2013· article· en· W1840932698 sur OpenAlexafffundvenue
Binod Babu Pageni, Newton Z. Lupwayi, Francis J. Larney, L. M. Kawchuk, Yantai Gan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésBiologySolanum tuberosumPhaseolusAgronomyCropBotanyCrop rotation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pageni, B. B., Lupwayi, N. Z., Larney, F. J., Kawchuk, L. M. and Gan, Y. 2013. Populations, diversity and identities of bacterial endophytes in potato ( Solanum tuberosum L.) cropping systems. Can. J. Plant Sci. 93: 1125–1142. Most plants host endophytic bacteria, but their identities and functions are usually unknown. Bacterial endophytes associated with potato grown after dry bean (Phaseolus vulgaris L.) or wheat (Triticum aestivum L.) were isolated, quantified and identified in a field study that compared crop rotations (3 to 6 yr in length) and soil management (CONV, conventional; CONS, conservation) for dry bean, potato, sugar beet (Beta vulgaris L.) and spring wheat. Populations of culturable endophytes ranged from 2.83×10 3 to 7.65×10 3 colony-forming units g −1 of root dry matter. The populations and diversity of the endophytes were greater with CONS than CONV soil management, and tended to be greater in longer than shorter rotations. The community structures of the endophytes were different between CONV and CONS soil management. A terminal-restriction fragment length polymorphism assay targeting the 16S rRNA gene, and its sequencing, showed that CONS management systems contained more Proteobacteria than CONV management systems, and vice-versa for Acidobacteria. Bacteriodetes were found only in long CONS rotations. This phylogenetic characterization of potato endophytes is important for further studies on their effects on the host plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,573
Score d'incertitude au seuil0,973

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,155 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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