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Enregistrement W1841348419

Narrowing of the autosomal recessive polycystic kidney disease critical region in a Newfoundland family

2000· dissertation· en· W1841348419 sur OpenAlexaboutno aff
Toby Frost

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2000
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneticsPositional cloningAutosomal Recessive Polycystic Kidney DiseaseDisease gene identificationBiologyUniGeneMicrosatelliteGenetic markerLocus (genetics)GenePolycystic kidney diseaseGenomeExpressed sequence tagMutationKidneyAllele
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A Newfoundland family, consisting of three nuclear families, was identified as having polycystic kidney and liver disease and found to be descended from two founding ancestral pairs. Using homozygosity mapping with polymorphic microsatellite markers, three disease loci, NPH-1, -2 and mouse bpk/jcpk were excluded and linked the disease in sibships A and B to the ARPKD disease loci on chromosome 6. Due to a meiotic recombination in one of the individuals in sibship A, the ARPKD critical region was narrowed to a 1cM region. The disease in sibship C was not linked to either of the abovementioned loci and kidney ultrasound suggested that the disease was not ADPKD. Because the gene which causes ARPKD is, as yet, unknown, it was necessary to attempt to identify it through positional cloning. A PAC contiguous map was constructed to allow the examination of smaller, individual pieces of DNA within the region. Each clone was subcloned and screened for microsatellites. Three were identified however none was variable in this family. The complete sequence of clone 108c2 had been published to the public domain and examination revealed a large repeat region which was analyzed and found to be polymorphic. This marker allowed the ARPKD region to be further refined to an area of approximately 560kb in size, completely covered by PAC clones. This region contains 10 known gene-oriented clusters representing different transcripts including NFYA, TFAP2B, MDFI and APOBEC2 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ UniGene).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,642
Score d'incertitude au seuil0,712

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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