The F-plasmid, a paradigm for bacterial conjugation
Notice bibliographique
Résumé
The F factor is often associated with Escherichia coli and appears to have been adapted by the bacterial host to act as an agent of genetic exchange and evolution. F encodes a type IV secretion system (T4SS) that enables bacterial conjugation, the transfer of DNA from a donor F + to a recipient F − cell. The delivery of DNA containing either host or foreign genes has important consequences for the bacterium, allowing it to enlarge or modify its genetic content and rapidly adapt to an environmental niche. Unlike other plasmids, the conjugative functions of F and F-like plasmids appear to be controlled by a complex regulatory network that involves many host proteins resulting in a symbiotic relation between F and its host. This chapter outlines the predicted and known functions for all the genes on the F plasmid and its close relatives, and describes our current knowledge about the regulation of F conjugation. BRIEF HISTORY OF THE F PLASMID The discovery of horizontal gene transfer between bacteria can be attributed to the work of Lederberg and Tatum (1946), who observed that different strains of E. coli K-12 could be genetically and phenotypically altered when mixed together. A series of experiments led to the conclusion that direct contact between bacteria was required in order for genetic material to be transferred between the cells (Davis, 1950). This transfer was found to occur in one direction, from donor to recipient cells, by a mechanism contained within the donor cells (Hayes, 1952).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».