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Enregistrement W1843373877 · doi:10.1107/s1600577515008437

Assessment of freeware programs for the reconstruction of tomography datasets obtained with a monochromatic synchrotron-based X-ray source

2015· article· en· W1843373877 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJournal of Synchrotron Radiation · 2015
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced X-ray Imaging Techniques
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaWestern Economic Diversification CanadaSaskatchewan Health Research FoundationCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of SaskatchewanCanadian Light Source
Mots-clésComputer scienceSoftwareBeamlineImage qualityNormalization (sociology)TomographyImage processingRadon transformArtificial intelligenceComputer graphics (images)Computer visionOpticsPhysicsBeam (structure)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synchrotron-based in-line phase-contrast computed tomography (PC-CT) allows soft tissue to be imaged with sub-gross resolution and has potential to be used as a diagnostic tool. The reconstruction and processing of in-line PC-CT datasets is a computationally demanding task; thus, an efficient and user-friendly software program is desirable. Four freeware programs (NRecon, PITRE, H-PITRE and Athabasca Recon) were compared for the availability of features such as dark- and flat-field calibration, beam power normalization, ring artifact removal, and alignment tools for optimizing image quality. An in-line PC-CT projection dataset (3751 projections, 180° rotation, 10.13 mm × 0.54 mm) was collected from a formalin-fixed canine prostate at the Biomedical Imaging and Therapy Bending Magnet (BMIT-BM) beamline of the Canadian Light Source. This dataset was processed with each of the four software programs and usability of the program was evaluated. Efficiency was assessed by how each program maximized computer processing power during computation. Athabasca Recon had the least-efficient memory usage, least user-friendly interface, and lacked a ring artifact removal feature. NRecon, PITRE and H-PITRE produced similar quality images, but the Athabasca Recon reconstruction suffered from the lack of a native ring remover algorithm. The 64-bit version of NRecon uses GPU (graphics processor unit) memory for accelerated processing and is user-friendly, but does not provide necessary parameters for in-line PC-CT data, such as dark-field and flat-field correction and beam power normalization. PITRE has many helpful features and tools, but lacks a comprehensive user manual and help section. H-PITRE is a condensed version of PITRE and maximizes computer memory for efficiency. To conclude, NRecon has fewer imaging processing tools than PITRE and H-PITRE, but is ideal for less experienced users due to a simple user interface. Based on the quality of reconstructed images, efficient use of computer memory and parameter availability, H-PITRE was the preferred of the four programs compared.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,632
Score d'incertitude au seuil0,498

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle