MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1847525421 · doi:10.1139/gen-2013-0045

Cytogenetic characterization by in situ hybridization techniques and molecular analysis of 5S rRNA genes of the European hazelnut (<i>Corylus avellana</i>)

2013· article· en· W1847525421 sur OpenAlexvenueno aff
Egizia Falistocco, Gianpiero Marconi

Notice bibliographique

RevueGenome · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Interactions Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGenomeGeneticsChromosomeCytogeneticsMolecular cytogeneticsRibosomal RNAKaryotypeGeneEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The European hazelnut (Corylus avellana L.) is widespread in Europe, where it has been cultivated for centuries. Despite progress in genetics, most of the cytogenetic aspects of this species have been overlooked. The aim of this study was to fill in this gap and obtain basic information on the chromosome structure of this species. Karyomorphological analysis confirmed the chromosome number 2n = 22 and showed that, despite their apparent uniformity, the chromosomes could be separated into three groups of different size: large (L), medium (M), and small (S). As a first step towards the physical mapping of the hazelnut chromosomes, we applied FISH to localize the position of rRNA genes (rDNA). The sites of 45S and 5S rDNA enabled us to identify two chromosome pairs belonging, respectively, to the L and S groups. The self-GISH procedure revealed that repetitive DNA is concentrated in the pericentromeric regions of the chromosomes, as with other species with rather small genomes. The analysis of 5S rDNA repeats offered additional information on the hazelnut genome by obtaining the whole sequence of the transcribed region so far unpublished. The overall results constitute a substantial advance in hazelnut cytogenetics. Further investigation of other species of Corylus could be an effective approach to understanding the phylogenesis of the genus and resolving taxonomic problems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenomeMême sujetPlant and Fungal Interactions ResearchTravaux en français237 207