A meta-analysis of seed protein concentration QTL in soybean
Notice bibliographique
Résumé
Qi, Z.-m., Sun Y.-n., Wu, Q., Liu, C.-y., Hu, G.-h. and Chen, Q.-s. 2011. A meta-analysis of seed protein concentration QTL in soybean. Can. J. Plant Sci. 91: 221–230. An integrated map of QTLs related to seed protein concentration in soybean has been constructed, based on the public genetic map, soymap2 as a reference map, along with a set of 107 QTLs reported in the literature over the past 20 yr. Each of these QTLs was projected onto the soymap2 by software package BioMercator v2.1. Twenty-three consensus QTLs were detected. The confidence interval at all sites ranged from 1.52 to 14.31cM, and the proportion of the phenotypic variance associated with each of them from 1.5 to 20.8%. Major chromosomal sites were identified on LG I (Gm20), four important sites were identified, involving LG A1 (Gm05), B2 (Gm14), E (Gm07) and M (Gm15). A meta-analysis approach was used to improve the precision of the location of these sites. These results facilitate gene mining and molecular assist-selection in soybean.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,010 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».