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Enregistrement W1850686194 · doi:10.1034/j.1399-0004.2003.t01-1-00110.x

Germline hMLH1 promoter mutation in a Newfoundland HNPCC kindred

2003· article· en· W1850686194 sur OpenAlexaffabout
RC Green, AG Green, Michelle Simms, Alan Pater, JD Robb, JS Green

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneticsGermline mutationBiologyMutationGeneDNA mismatch repairMutantMolecular biologyDNA repair

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hereditary non-polyposis colon cancer (HNPCC) is an autosomal dominant form of inherited predisposition to colorectal and other malignancies. It is associated with mutations in DNA mismatch-repair genes, especially hMSH2 and hMLH1. Management of HNPCC families is improved if the underlying mutation in each family can be discovered. We describe a Newfoundland kindred, meeting the Amsterdam Criteria for HNPCC, in which a mutation in the promoter region of the hMLH1 gene co-segregates with the disease phenotype. The -42C > T mutation is within a putative Myb proto-oncogene binding site. Using electrophoretic mobility shift assays, we demonstrated that the mutated Myb binding sequence is less effective in binding nuclear proteins than the wild-type promoter sequence. Using in vivo transfection experiments in HeLa cells, we further demonstrated that the mutated promoter has only 37% of the activity of the wild-type promoter in driving the expression of a reporter gene. The average age of onset in six family members affected with colorectal cancer is 62 years, which is substantially later than the typical age of onset in HNPCC families. This is consistent with a substantial decrease, but not total elimination, of mismatch repair function in affected members of this family. This is the first report of a heritable hMLH1 promoter mutation in any HNPCC family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,609

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,398
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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