Organic anion transporter 2 transcript variant 1 shows broad ligand selectivity when expressed in multiple cell lines
Notice bibliographique
Résumé
Organic anion transporter 2 (OAT2) is likely important for renal and hepatic drug elimination. Three variants of the OAT2 peptide sequence have been described - OAT2 transcript variant 1 (OAT2-tv1), OAT2 transcript variant 2 (OAT2-tv2), and OAT2 transcript variant 3 (OAT2-tv3). Early studies helping to define the ligand selectivity of OAT2 failed to identify the variant used, and the studies used several heterologous expression systems. In preliminary studies using OAT2-tv1, we failed to observe transport of several previously identified substrates, leading us to speculate that ligand selectivity of OAT2 differs with variant and/or heterologous expression system. The purpose was to further investigate the ligand selectivity of the OAT2 variants expressed in multiple cell types. We cloned OAT2-tv1 and OAT2-tv2, but were unsuccessful at amplifying mRNA for OAT2-tv3 from human kidney. OAT2-tv1 and OAT2-tv2 were individually expressed in human embryonic kidney (HEK), Madin-Darby canine kidney (MDCK), or Chinese hamster ovary (CHO) cells. mRNA for OAT2-tv1 and OAT2-tv2 was demonstrated in each cell type transfected with the respective construct, indicating their expression. OAT2-tv1 trafficked to the plasma membrane of all three cell types, but OAT2-tv2 did not. OAT2-tv1 transported penciclovir in all three cell types, but failed to transport para-aminohippurate, succinate, glutarate, estrone-3-sulfate, paclitaxel or dehydroepiandrosterone sulfate - previously identified substrates of OAT2-tv2. Not surprising given its lack of plasma membrane expression, OAT2-tv2 failed to transport any of the organic solutes examined, including penciclovir. Penciclovir transport by OAT2-tv1 was sensitive to large (e.g., cyclosporine A) and small (e.g., allopurinol) organic compounds, as well as organic anions, cations and neutral compounds, highlighting the multiselectivity of OAT2-tv1. The potencies with which indomethacin, furosemide, cyclosporine A and cimetidine inhibited OAT2-tv1 are in good agreement with previous studies using this variant, but inconsistent with studies using OAT2 with an unidentified sequence. This study shows that organic molecules with diverse physicochemical properties interact with OAT2-tv1, making it a likely site of drug interactions. Many previously identified substrates of OAT2 are not transported by OAT2-tv1, suggesting that variant and/or expression system may contribute. Future work should establish the expression pattern and ligand selectivity of OAT2-tv3.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».