Genetic diversity and structure in Canadian northern leopard frog (<i>Rana pipiens</i>) populations: implications for reintroduction programs
Notice bibliographique
Résumé
The northern leopard frog ( Rana pipiens Schreber, 1782) underwent a large decline in the western portion of its range and only occurs in 20% of historically occupied sites in Alberta. Its absence may reflect an inability to disperse to these sites because of habitat fragmentation, and human-mediated translocation has been proposed. In this study, we used three criteria to examine the genetic suitability of potential translocation sources: diversity, similarity to area of reintroduction, and evolutionary history. We genotyped 187 samples and sequenced 812 bp of the mitochondrial NADH dehydrogenase 1 gene from 14 Canadian northern leopard frog populations. Nuclear and mitochondrial diversity were highest in Manitoba and western Ontario and declined westward. There was no significant relationship between genetic and geographic distance, suggesting that genetic drift is a driving force affecting the genetic relationships between populations. Regions separated by more than ~50 km were quite differentiated. Therefore, source populations similar to the original inhabitants of an area for reintroduction may be uncommon. Mitochondrial analyses revealed that all populations share a close evolutionary history, belonging to the western haplotype group. While genetic criteria support the use of Manitoba and Ontario as sources, the desirability of environmental similarity to the reintroduction site suggests that ecologically exchangeable Alberta populations should also be considered.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».