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Enregistrement W1856375891 · doi:10.1309/ajcpk0y1mmfsjdku

Evaluation of Quantitative Digital Pathology in the Assessment of Barrett Esophagus–Associated Dysplasia

2015· article· en· W1856375891 sur OpenAlexaff
Soufiane El Hallani, Martial Guillaud, Jakoda Korbelik, Esmeralda Celia Marginean

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Clinical Pathology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEsophageal Cancer Research and Treatment
Établissements canadiensCanadian Centre for Applied Research in Cancer ControlBC Cancer AgencyUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDysplasiaGrading (engineering)EsophagusPathologyBarrett's esophagusBiopsyAdenocarcinomaMedicineBiologyInternal medicineCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Barrett esophagus (BE) is a precursor lesion that confers an increased risk of esophageal adenocarcinoma. Two issues confront the diagnosis of patients with BE: (1) sampling error at the time of endoscopy and (2) variability among pathologists in grading dysplasia. The purpose of our study was to evaluate quantitative digital pathology (QDP) as a marker of dysplasia and stratification from low-grade to high-grade dysplasia to intramucosal adenocarcinoma in BE. METHODS: Sixty-one esophageal biopsy specimens with BE were selected and divided into six groups according to the dysplasia grade. QDP image analysis was carried out by an in-house automated quantitative system on sections. The values of 110 nuclear features that analyze the morphology and chromatin texture were generated for each nucleus. RESULTS: A progressive correlation was found between nuclear morphometric features and chromatin features with BE dysplasia. The chromatin texture was the best discriminator of the class diagnosis. There was a significant difference between the chromatin features of isolated low-grade dysplasia vs low-grade dysplasia that was associated with higher grade lesions in other biopsy tissue fragments. CONCLUSIONS: QDP is a promising tool in the new era of digital pathology. Pending clinical validation studies, analysis of chromatin texture could contribute to the differential diagnosis of BE class and the detection of concomitant high-grade lesions if not sampled.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,187
Tête enseignante GPT0,531
Écart entre enseignants0,344 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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