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Enregistrement W1856738390 · doi:10.1002/9780470015902.a0022872

Evolution of Eukaryotic <scp>RNA</scp> Polymerases

2010· other· en· W1856738390 sur OpenAlexaff
Guy Drouin, Robert Carter

Notice bibliographique

RevueEncyclopedia of Life Sciences · 2010
Typeother
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNA polymerase IPolymeraseSmall nuclear RNABiologyRNA polymerase IIIRNARNA-dependent RNA polymeraseRNA polymerase II holoenzymeRNA polymerase IIRNA polymeraseTranscription factor II DTranscription (linguistics)RNA editingGeneticsGeneMolecular biologyGene expressionPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ribonucleic acid (RNA) polymerases are responsible for the transcription of deoxyribonucleic acid (DNA) into RNA. The number of protein subunits making up these enzymes has increased during evolution from 5 in Eubacteria to 12 in the common ancestor of Archaea and eukaryotes. Eukaryotes have three RNA polymerases , each transcribing a particular subset of genes. RNA polymerase I transcribes ribosomal RNA genes, RNA polymerase II transcribes messenger RNA genes and RNA polymerase III transcribes 5S and transfer RNA genes. Although RNA polymerase II is still made up of 12 subunits, the number of subunits has increased to 14 in RNA polymerase I and to 17 in RNA polymerase III . These new subunits originated from the permanent recruitment of pre‐existing general transcription factors. Interestingly, the evolution of the three eukaryotic RNA polymerases has been affected not only by adaptive forces but also by the nonadaptive forces due to the concerted evolution of the genes they transcribe. Key Concepts: The larger numbers of protein subunits found in RNA polymerases I and III, relative to RNA polymerase II, are due to the permanent recruitment of general transcription factors. The three universal eukaryotic RNA polymerases have specific functional differences near their respective active sites. During evolution, the three eukaryotic RNA polymerase have been selected to better perform their specific tasks. The rate of evolution of RNA polymerases is proportional to the amount of homogenisation (concerted evolution) experienced by the genes they transcribe. Nonadaptive processes therefore also affect the rate of evolution of RNA polymerase genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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