MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1858691702 · doi:10.1002/jcb.25309

The Glutamine-Alanine Repeat Domain of TCERG1 is Required for the Inhibition of the Growth Arrest Activity of C/EBPα

2015· article· en· W1858691702 sur OpenAlexafffund
Nicholas J. Miller, Kaitlyn Schick, Nikolai A. Timchenko, Emmett Harrison, William J. Roesler

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGlutamineAlanineChemistryDomain (mathematical analysis)BiochemistryCell biologyBiologyAmino acidMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TCERG1 was characterized previously as a repressor of the transcription factor C/EBPα through a mechanism that involved relocalization of TCERG1 from nuclear speckles to pericentromeric regions. The inhibitory activity as well as the relocalization activity has been demonstrated to lie in the amino terminal half of the protein, which contains several discrete motifs including an imperfect glutamine-alanine (QA) repeat. In the present study, we showed that deletion of this domain completely abrogated the ability of TCERG1 to inhibit the growth arrest activity of C/EBPα. Moreover, the QA repeat deletion mutant of TCERG1 lost the ability to be relocalized from nuclear speckles to pericentromeric regions, and caused an increase in the average size of individual speckles. We also showed that deletion of the QA repeat abrogated the complex formation between TCERG1 and C/EBPα. Examination of mutants with varying numbers of QA repeats indicated that a minimal number of repeats are required for inhibitory activity as well as relocalization ability. These data contribute to our overall understanding of how TCERG1 can have gene-specific effects in addition to its more general roles in coordinating transcription elongation and splicing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,282

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Cellular BiochemistryMême sujetMitochondrial Function and PathologyTravaux en français237 207