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Enregistrement W1860217797 · doi:10.1890/14-0126.1

Detecting cyclicity in ecological time series

2015· article· en· W1860217797 sur OpenAlexaff
Stilianos Louca, Michael Doebeli

Notice bibliographique

RevueEcology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcosystem dynamics and resilience
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNull hypothesisNull (SQL)White noisePopulation cycleNull modelSeries (stratigraphy)PopulationNoise (video)UncorrelatedEcologyStatistical hypothesis testingStatistical physicsStatisticsBiological systemMathematicsEconometricsBiologyComputer scienceArtificial intelligenceData miningPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cyclic population dynamics are of central interest in ecology. Reliably identifying and quantifying the cyclicity of populations is valuable for the understanding of regulatory mechanisms and their variability across spatiotemporal scales. Cyclicity can be detected using periodogram analysis of time series. The statistical significance of periodogram peaks is commonly evaluated against the null hypothesis of uncorrelated fluctuations, also known as white noise. Here, we show that this null hypothesis is inadequate for cycle detection in ecosystems with non‐negligible correlation times. As an alternative null hypothesis we propose the so‐called Ornstein‐Uhlenbeck state‐space (OUSS) model, which generalizes white noise to allow for temporal correlations. We justify its use on mechanistic principles and demonstrate its advantages using numerical simulations of simple population models. We show that merely contrasting cyclicity against white noise greatly increases the false cycle detection rate and can lead to wrong conclusions even for simple systems. A comparative statistical analysis of the Global Population Dynamics Database using both null hypotheses suggests that a significant number of populations might have been misinterpreted as cyclic in the past. Our proposed methods for cycle detection are available as an R package (peacots).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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