Genetic diversity of side-oats grama [<i>Bouteloua curtipendula</i>(Michx.) Torr.] populations as revealed by amplified fragment length polymorphism markers
Notice bibliographique
Résumé
Biligetu, B., Schellenberg, M. P. and Fu, Y.B. 2013. Genetic diversity of side-oats grama [Bouteloua curtipendula (Michx.) Torr.] populations as revealed by amplified fragment length polymorphism markers. Can. J. Plant Sci. 93: 1105–1114. Side-oats grama [Bouteloua curtipendula (Michx.) Torr.] is a warm-season grass widely distributed in North America and is considered as an important grass for reclamation and summer forage production in drier regions. This study assessed genetic diversity of nine wild populations of side-oats grama grass, their corresponding balanced multiple-site composite (BMSC), and a population selected for forage type (FT), using the amplified fragment length polymorphism (AFLP) technique. Five AFLP primer pairs were employed to genotype 157 plants, and 312 polymorphic AFLP bands were detected. The frequencies of AFLP bands ranged from 0.01 to 0.99, and averaged 0.39. The AFLP analysis revealed 6% of the total AFLP variation present among the nine wild populations and 94% of variation within populations. The Minto population had the largest within-population diversity, while the FT population the lowest based on AFLP band richness and polymorphic loci. The BMSC population displayed significant genetic differentiation from the wild populations, but still captured substantial genetic diversity. Bayesian cluster analysis using BAPS and STRUCTURE programs revealed three and four optimal clusters of populations that explained 9.8 and 9.5% of the total AFLP variation, respectively. A genetic clustering of individual plants displayed no clear genetic separations among wild, FT, and BMSC populations, but the FT population showed some level of genetic shift, indicating the initial impact of artificial selection. These findings are significant for our understanding of the genetic diversity of side-oats grama. Large genetic variation present within populations provides a potential for further genetic enhancement.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».