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Enregistrement W1860512683 · doi:10.1002/bdra.23255

Planar cell polarity gene mutations contribute to the etiology of human neural tube defects in our population

2014· review· en· W1860512683 sur OpenAlexaff
Patrizia De Marco, Elisa Merello, Gianluca Piatelli, Armando Cama, Zoha Kibar, Valeria Capra

Notice bibliographique

RevueBirth Defects Research Part A Clinical and Molecular Teratology · 2014
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeural tubeDishevelledFrizzledGeneticsBiologyMissense mutationWnt signaling pathwayGeneNonsynonymous substitutionMutationPhenotypeNeurulationEmbryogenesisGastrulationGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neural Tube Defects (NTDs) are congenital malformations that involve failure of the neural tube closure during the early phases of development at any level of the rostro-caudal axis. The planar cell polarity (PCP) pathway is a highly conserved, noncanonical Wnt-Frizzled-Dishevelled signaling cascade, that was first identified in the fruit fly Drosophila. We are here reviewing the role of the PCP pathway genes in the etiology of human NTDs, updating the list of the rare and deleterious mutations identified so far. We report 50 rare nonsynonymous mutations of PCP genes in 54 patients having a pathogenic effect on the protein function. Thirteen mutations that have previously been reported as novel are now reported in public databases, although at very low frequencies. The mutations were private, mostly missense, and transmitted by a healthy parent. To date, no clear genotype-phenotype correlation has been possible to create. Even if PCP pathway genes are involved in the pathogenesis of neural tube defects, future studies will be necessary to better dissect the genetic causes underlying these complex malformations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,440
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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