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Enregistrement W1862613154 · doi:10.1101/gad.14.13.1651

A family of <i>rhomboid</i>-like genes: <i>Drosophila rhomboid-1</i> and <i>roughoid/rhomboid-3</i> cooperate to activate EGF receptor signaling

2000· article· en· W1862613154 sur OpenAlexfundno aff
Jonathan D. Wasserman, Siniša Urban, Matthew Freeman

Notice bibliographique

RevueGenes & Development · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRhomboidBiologySignal transductionGeneCell biologyFunction (biology)Transmembrane proteinGeneticsReceptorBiochemistryProteases

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As in mammals, the Drosophila EGF receptor controls many aspects of growth and development. The rate limiting component of Drosophila Egfr signaling is Rhomboid, a seven transmembrane domain protein, whose expression prefigures Egfr signaling. Little is known about the molecular mechanism of Rhomboid function but genetic evidence suggests that it controls the activation of the ligand Spitz, a TGFalpha-like factor. Spitz/Egfr signaling regulates cell determination in the eye but here there is no apparent function for Rhomboid, an observation that casts doubt on this prevailing model of Rhomboid function. We describe our identification of six new rhomboid-like genes in Drosophila, and a large family of related genes present in organisms as diverse as bacteria and mammals; a human rhomboid homolog has also recently been described. Drosophila rhomboid-3 corresponds to the roughoid mutation; it cooperates with rhomboid-1 to control Egfr signaling in the eye, thereby solving the puzzle of the apparent lack of Rhomboid-1 function there. Rhomboid-1 and Roughoid/Rhomboid-3 act in the signal-emitting not signal-receiving cell, supporting the idea that Spitz activation is regulated by Rhomboid-like molecules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations179
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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