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Enregistrement W1865996501 · doi:10.1021/acs.joc.5b02083

Development of an Orthogonal Protection Strategy for the Synthesis of Mycobacterial Arabinomannan Fragments

2015· article· en· W1865996501 sur OpenAlexafffund
Kamar Sahloul, Todd L. Lowary

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Organic Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensAlberta Glycomics CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Glycomics CentreBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésLipoarabinomannanChemistryGlycosylationTetrasaccharideGlycanMycobacterium tuberculosisAntigenTuberculosisAntibodyCombinatorial chemistryComputational biologyStereochemistryBiochemistryPolysaccharideGlycoproteinImmunologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycobacterium tuberculosis, the organism that causes tuberculosis (TB), has a carbohydrate-rich cell wall structure that possesses a number of immunogenic antigens. Circulating antibodies that recognize these glycans are present in patients infected by mycobacteria; detection of these antibodies could be the basis for new TB diagnostics. We describe here the synthesis of a panel of mycobacterial arabinomannan fragments for use in investigations directed at testing the feasibility of such a diagnostic method. In this study, we focused on structural motifs present in the core of the key immunogenic polysaccharide lipoarabinomannan (LAM). To access these compounds, we developed an efficient orthogonal protection strategy that allowed access to seven arabinomannan fragments of LAM (1-7). The targets included one tetrasaccharide, one pentasaccharide, three octasaccharides, and two nonasaccharides. Starting from a differentially protected trimannopyranoside derivative (8 or 9), the targets were obtained using an approach that involved selective removal of the protecting group present at the O-2 position of a single mannopyranoside residue, followed by glycosylation with a pentaarabinofuranose thioglycoside and/or a mannopyranose trichloroacetimidate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,857

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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