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Enregistrement W1866364567 · doi:10.1111/2041-210x.12458

BiMat: a MATLAB package to facilitate the analysis of bipartite networks

2015· article· en· W1866364567 sur OpenAlex
César O. Flores, Timothée Poisot, Sergi Valverde, Joshua S. Weitz

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMethods in Ecology and Evolution · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesMinisterio de Economía y CompetitividadBurroughs Wellcome FundFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesNational Science Foundation
Mots-clésNestednessBipartite graphModularity (biology)Computer scienceEcological networkFeature (linguistics)Modular designTheoretical computer scienceNetwork analysisInteraction networkComplex networkMATLABData miningR packageDistributed computingArtificial intelligenceEcologyBiologyGraphWorld Wide WebEvolutionary biologyComputational science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Bipartite networks are ubiquitous in community ecology, including examples of facilitative interactions, such as plant‐pollinator networks, and antagonistic interactions, such as virus–host infection networks. Statistical network analysis is increasingly used to identify emergent, nonrandom patterns of interaction and the effect of interaction patterns on ecological and evolutionary dynamics. Two recurring patterns are that of modularity and nestedness. Modularity is a feature of networks in which there are densely interacting subgroups. Nestedness is a feature of networks in which the interactions form ordered subsets. Here we describe BiMat , an open‐source MATLAB package for the study of the structure of bipartite ecological networks. Unlike alternative tools, BiMat enables both multiscale analysis of the structure of a bipartite ecological network – spanning global (i.e. entire network) to local (i.e. module‐level) scales – and meta‐analyses of many bipartite networks simultaneously. In common with other tools, BiMat calculates the degree to which a bipartite network is modular and/or nested, the statistical significance of these patterns, and enables visualization of latent structures in the network. BiMat is available as an open‐source MATLAB package, with a quick‐start guide and worked examples at: http://bimat.github.io/ .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,879

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,146
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle