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Enregistrement W1867991976 · doi:10.1111/j.1365-294x.2007.03685.x

Small‐scale spatial genetic structure in the Central African rainforest tree species <i>Aucoumea klaineana</i>: a stepwise approach to infer the impact of limited gene dispersal, population history and habitat fragmentation

2008· article· en· W1867991976 sur OpenAlexfundno aff
Céline Born, Olivier J. Hardy, Marie‐Hélène Chevallier, Simon Ossari, Christiane Attéké, E. Jean Wickings, MARTINE HOSSAERT‐MCKEY

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCentre International de Recherches Médicales de FrancevilleAgence Universitaire de la Francophonie
Mots-clésBiological dispersalBiologyEcologyIsolation by distanceHabitat fragmentationGenetic structurePopulationGene flowGenetic driftGenetic diversityRange (aeronautics)Effective population sizeHabitatGenetic variationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Under the isolation-by-distance model, the strength of spatial genetic structure (SGS) depends on seed and pollen dispersal and genetic drift, which in turn depends on local demographic structure. SGS can also be influenced by historical events such as admixture of differentiated gene pools. We analysed the fine-scale SGS in six populations of a pioneer tree species endemic to Central Africa, Aucoumea klaineana. To infer the impacts of limited gene dispersal, population history and habitat fragmentation on isolation by distance, we followed a stepwise approach consisting of a Bayesian clustering method to detect differentiated gene pools followed by the analysis of kinship-distance curves. Interestingly, despite considerable variation in density, the five populations situated under continuous forest cover displayed very similar extent of SGS. This is likely due to an increase in dispersal distance with decreased tree density. Admixture between two gene pools was detected in one of these five populations creating a distinctive pattern of SGS. In the last population sampled in open habitat, the genetic diversity was in the same range as in the other populations despite a recent habitat fragmentation. This result may due to the increase of gene dispersal compensating the effect of the disturbance as suggested by the reduced extent of SGS estimated in this population. Thus, in A. klaineana, the balance between drift and dispersal may facilitate the maintenance of genetic diversity. Finally, from the strength of the SGS and population density, an indirect estimate of gene dispersal distances was obtained for one site: the quadratic mean parent-offspring distance, sigma(g), ranged between 210 m and 570 m.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,146
Score d'incertitude au seuil0,538

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations138
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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