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Enregistrement W186868943 · doi:10.1042/bj20021301

Down-regulation of alphav/beta3 integrin via misrouting to lysosomes by overexpression of a beta3Lamp1 fusion protein

2003· article· en· W186868943 sur OpenAlexaff
Magali Conesa, Annik Prat, John S. Mort, Jacques Marvaldi, Jean‐Claude Lissitzky, Nabil G. Seidah

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Children's HospitalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHEK 293 cellsCell biologyIntegrinEctodomainVitronectinEndosomeEndoplasmic reticulumLAMP1Fusion proteinTetraspaninTransmembrane proteinProtein subunitTransfectionBiologyChemistryCellReceptorCell cultureBiochemistryRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present a general strategy for the dominant negative reduction in the levels of type-1 membrane-bound heterodimeric proteins within the secretory pathway through fusion of the soluble ectodomain of one of the partners to the transmembrane-cytosolic tail of the lysosomal protein Lamp1. Thus, in human embryonic kidney (HEK)-293 cells, overexpression of an integrin beta 3Lamp1 chimera resulted in a drastic reduction of its endogenous partner, the integrin alpha v subunit. The mechanism involves the formation in the endoplasmic reticulum of a alpha v/beta 3Lamp1 complex that is subsequently sorted towards a lysosomal/endosomal degradation pathway. The specificity of this approach is afforded by the invariance in the levels of the endogenous integrins alpha 5 and beta1 as compared with control cells. Conversely overexpression of integrin beta 3 in HEK-293 cells led to an increased level of alpha v beta 3 at the cell surface. Functionally beta 3Lamp1 and beta 3 overexpressors exhibit decreased and increased adhesion to vitronectin, respectively, as well as diminished cellular aggregation. The application of this technology should enable the analysis of the functional importance of homodimers or heterodimers in the cell types of choice and the identification of novel partner proteins by proteomic approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,675

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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