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Enregistrement W1869266468 · doi:10.1139/cjc-2015-0173

Vesicle self-assembly of amphiphilic siderophores produced by bacterial isolates from Soap Lake, Washington

2015· article· en· W1869266468 sur OpenAlexvenueno aff
Luis O. De Serrano, Betsey Pitts, Masaki Uchida, Abigail Richards

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWashington State UniversityNational Science Foundation
Mots-clésSiderophoreVesicleHalomonasAmphiphileBacteriaChemistryFerricMicelleDynamic light scatteringAkaganéiteMicrobiologyBiochemistryNanotechnologyOrganic chemistryBiologyMaterials scienceMembraneAqueous solution16S ribosomal RNACopolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soap Lake, located in Washington State, is a meromictic soda lake that was the subject of a prior National Science Foundation funded Microbial Observatory. Several organisms inhabiting this lake have been identified as producers of siderophores that are unique in structure. Two isolates found to be of the species Halomonas, SL01 and SL28, were found to produce suites of amphiphilic siderophores consisting of a peptidic head-group, which binds iron appended to fatty acid moieties of various lengths. The ability for siderophores to self-assemble into vesicles was determined for three suites of amphiphilic siderophores of unique structure (two from SL01 and one from SL28). These siderophores resemble the amphiphilic aquachelin siderophores produced by Halomonas aquamarina strain DS40M3, a marine bacterium. Vesicle self-assembly studies were performed by dynamic light scattering and epifluorescence microscopy. The addition of ferric iron (Fe3+) at different equivalents, where an equivalence of iron is defined as equal to the molarity of the siderophore, demonstrated vesicle formation. This was suggested by both dynamic light scattering and epifluorescence microscopy. Bacteria thriving under saline and alkaline conditions are capable of producing unique siderophores that self-assemble in micelles and vesicles due to ferric iron chelation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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