A picture tells a thousand words: transmission electron microscopy of the ciliary transition zone in C. elegans
Notice bibliographique
Résumé
Transmission electron microscopy (TEM) is a valuable tool for elucidating cilium ultrastructure and the effects of ciliary and ciliopathy gene mutations on cilium integrity. We perform TEM on amphid channel sensory cilia in C. elegans, enabling us to visualise cilium compartments, namely the axoneme, the transition zone (TZ) and the transition fiber/basal body region. In worms, cilia extend from the dendritic tips of 60 sensory neurons. Here we show how TEM can be used to identify ultrastructural defects observed at the TZ of a number of ciliopathy disease gene mutants. In WT worms, the ~1 micron TZ is the most proximal part of the axoneme that extends from the far distal dendrite membrane, and is defined by a drawing together of the 9 doublet microtubules (MT) and Y-links that connect the doublet MTs with the ciliary membrane. In worms with mutations in Meckel-Gruber Syndrome (MKS) and Nephronophthisis (NPHP) gene homologues, we have observed a range of TZ abnormalities. These include TZs with Y-link defects (missing arms, reduced numbers) and TZs that fail to dock at the tip of the dendritic compartment. In most instances, TZ defects are observed only in worms where both MKS and NPHP functional modules are genetically disrupted and not in worms where only one module is abrogated. Together, our observations indicate redundant roles for multiple TZ-associated ciliopathy proteins in establishing physical connections between the TZ and the ciliary membrane.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,006 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,087 | 0,027 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».