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Enregistrement W1870052210 · doi:10.1186/2046-2530-1-s1-p18

A picture tells a thousand words: transmission electron microscopy of the ciliary transition zone in C. elegans

2012· article· en· W1870052210 sur OpenAlexaff
Rachel V. Bowie, Katarzyna Kida, Michel R. Leroux, Oliver E. Blacque

Notice bibliographique

RevueCilia · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCiliopathyAxonemeCiliumBiologyBasal bodyCell biologyMotile ciliumCiliogenesisNephronophthisisIntraflagellar transportUltrastructureMutantAnatomyGeneticsGeneFlagellum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transmission electron microscopy (TEM) is a valuable tool for elucidating cilium ultrastructure and the effects of ciliary and ciliopathy gene mutations on cilium integrity. We perform TEM on amphid channel sensory cilia in C. elegans, enabling us to visualise cilium compartments, namely the axoneme, the transition zone (TZ) and the transition fiber/basal body region. In worms, cilia extend from the dendritic tips of 60 sensory neurons. Here we show how TEM can be used to identify ultrastructural defects observed at the TZ of a number of ciliopathy disease gene mutants. In WT worms, the ~1 micron TZ is the most proximal part of the axoneme that extends from the far distal dendrite membrane, and is defined by a drawing together of the 9 doublet microtubules (MT) and Y-links that connect the doublet MTs with the ciliary membrane. In worms with mutations in Meckel-Gruber Syndrome (MKS) and Nephronophthisis (NPHP) gene homologues, we have observed a range of TZ abnormalities. These include TZs with Y-link defects (missing arms, reduced numbers) and TZs that fail to dock at the tip of the dendritic compartment. In most instances, TZ defects are observed only in worms where both MKS and NPHP functional modules are genetically disrupted and not in worms where only one module is abrogated. Together, our observations indicate redundant roles for multiple TZ-associated ciliopathy proteins in establishing physical connections between the TZ and the ciliary membrane.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,355

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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Résumé présentoui

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