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Enregistrement W1870139434 · doi:10.1139/b05-086

Conidial morphology, virulence, molecular characterization, and host–parasite interactions of selected <i>Alternaria panax</i> isolates on American ginseng

2005· article· en· W1870139434 sur OpenAlexafffundvenueabout
H. A. Quayyum, Katherine F. Dobinson, J. A. Traquair

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyGinsengConidiumVirulenceBotanyMicrobiologyAmerican ginsengGerminationGerm tubeMagnaporthe griseaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fungus Alternaria panax Whetzel causes leaf and stem blight of American ginseng ( Panax quinquefolius L.). Six isolates of A. panax, collected from widely separated ginseng-growing areas in North America, were characterized on the basis of their colony and conidial morphology, molecular characteristics, and virulence. Colony morphology on standard media and conidial morphology based on light microscopy showed some variation with geographic locality: Wisconsin isolates were slightly different from Ontario and British Columbia isolates. Isolates from each locality were equally virulent on American ginseng. Ginseng phytotoxin was present in the conidial germination fluid of all isolates. Sequences of the β-tubulin gene from all six isolates were identical as were the sequences of the internal transcribed spacer (ITS) region of the rDNA gene. The ITS1 and ITS2 gene sequences of the six isolates were also identical to those of American and Korean isolates of A. panax deposited in GenBank. Cellulase and pectinase were detected by agar biodiffusion assays of a representative isolate. Germination of conidia of this isolate on ginseng leaflets began within 2 h of application to leaf surfaces, and over 80% of conidia germinated within 12 h of application. Conidia produced one to several germ tubes that grew in all directions over the leaflet surface. The germ tubes formed terminal appressoria over stomatal openings, epidermal cells, and epidermal cell junctions. The frequency of direct penetration into ginseng leaflets was greater than penetration through stomata. Both retraction of plasma membrane and disruption of chloroplast membranes were observed 12 h after leaflet inoculation. At 24 h after inoculation, hyphae were present in both intercellular spaces and inside mesophyll cells. Severe disruption of plasma membrane, chloroplasts, and mitochondria was observed between 24 and 48 h after inoculation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2005
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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