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Enregistrement W1871800366 · doi:10.1002/glia.22923

Functional organization of an <i>Mbp</i> enhancer exposes striking transcriptional regulatory diversity within myelinating glia

2015· article· en· W1871800366 sur OpenAlexaff
Nancy Dionne, Samar Dib, Bente Finsen, Éric Denarier, Tanja Kuhlmann, Régen Drouin, Maia V. Kokoeva, Thomas J. Hudson, Kathy Siminovitch, Hana Friedman, Alan C. Peterson

Notice bibliographique

RevueGlia · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoAmgen (Canada)Ontario Institute for Cancer ResearchMcGill University Health CentreUniversité de SherbrookeMcGill University
Organismes subventionnairesNational Multiple Sclerosis Society Michigan Chapter
Mots-clésBiologyDiversity (politics)Functional diversityEnhancerNeuroscienceComputational biologyEvolutionary biologyCognitive scienceGeneticsGeneTranscription factorEcologySociologyPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In mammals, large caliber axons are ensheathed by myelin, a glial specialization supporting axon integrity and conferring accelerated and energy-efficient action potential conduction. Myelin basic protein (MBP) is required for normal myelin elaboration with maximal mbp transcription in oligodendrocytes requiring the upstream M3 enhancer. To further characterize the mechanism regulating mbp transcription, we defined M3 structure/function relationships by evaluating its evolutionary conservation, DNA footprints and the developmental programing conferred in mice by M3 derivatives. Multiple M3 regulatory element combinations were found to drive expression in oligodendrocytes and Schwann cells with a minimal 129 bp sequence conferring expression in oligodendrocytes throughout myelin elaboration, maintenance and repair. Unexpectedly, M3 derivatives conferred markedly different spatial and temporal expression programs thus illuminating striking transcriptional heterogeneity within post-mitotic oligodendrocytes. Finally, one M3 derivative engaged only during primary myelination, not during adult remyelination, demonstrating that transcriptional regulation in the two states is not equivalent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,326

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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