Novel globoside‐like oligosaccharide expression patterns in nontypeable <i>Haemophilus influenzae</i> lipopolysaccharide
Notice bibliographique
Résumé
We report the novel pattern of lipopolysaccharide (LPS) expressed by two disease-associated nontypeable Haemophilus influenzae strains, 1268 and 1200. The strains express the common structural motifs of H. influenzae; globotetraose [beta-d-GalpNAc-(1-->3)-alpha-d-Galp-(1-->4)-beta-d-Galp-(1-->4)-beta-d-Glcp] and its truncated versions globoside [alpha-d-Galp-(1-->4)-beta-d-Galp-(1-->4)-beta-d-Glcp] and lactose [beta-d-Galp-(1-->4)-beta-d-Glcp] linked to the terminal heptose (HepIII) and the corresponding structures with an alpha-d-Glcp as the reducing sugar linked to the middle heptose (HepII) in the same LPS molecule. Previously these motifs had been found linked only to either the proximal heptose (HepI) or HepIII of the triheptosyl inner-core moiety l-alpha-d-Hepp-(1-->2)-[PEtn-->6]-l-alpha-d-Hepp-(1-->3)-l-alpha-d-Hepp-(1-->5)-[PPEtn-->4]-alpha-Kdo-(2-->6)-lipid A. This novel finding was obtained by structural studies of LPS using NMR techniques and ESI-MS on O-deacylated LPS and core oligosaccharide material, as well as electrospray ionization-multiple-step tandem mass spectrometry on permethylated dephosphorylated oligosaccharide material. A lpsA mutant of strain 1268 expressed LPS of reduced complexity that facilitated unambiguous structural determination. Using capillary electrophoresis-ESI-MS/MS we identified sialylated glycoforms that included sialyllactose as an extension from HepII, this is a further novel finding for H. influenzae LPS. In addition, each LPS was found to carry phosphocholine and O-linked glycine. Nontypeable H. influenzae strain 1200 expressed identical LPS structures to 1268 with the difference that strain 1200 LPS had acetates substituting HepIII, whereas strain 1268 LPS has glycine at the same position.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».