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Enregistrement W1872173945 · doi:10.1139/bcb-2013-0026

Screening for novel cell adhesive regions in bovine Achilles tendon collagen peptides

2013· article· en· W1872173945 sur OpenAlexvenueno aff
Pradipta Banerjee, Alka Mehta, C. Shanthi

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueCollagen: Extraction and Characterization
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCentral Leather Research InstituteVIT UniversityIndian Institute of Science
Mots-clésPeptideCell adhesionChemistryAdhesionAchilles tendonIntegrinCellAdhesiveChromatographyProteaseBiochemistryTendonEnzymeAnatomyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Collagen, a major structural protein of the ECM, is known for its high cell adherence capacity. This study was conducted to identify regions in collagen that harbour such bioactivity. Collagen from tendon was hydrolysed and the peptides fractionated using ion-exchange chromatography (IEC). Isolated peptide fractions were coated onto disposable dishes and screened for cell adherence and proliferative abilities. Active IEC fractions were further purified by chromatography, and two peptides, C2 and E1 with cell adhesion ability, were isolated. A cell adhesion assay done with different amounts of C2 coated onto disposable dishes revealed the maximum adhesion to be 94.6%, compared with 80% for collagen coated dishes and an optimum peptide coating density of 0.507 nmoles per cm(2) area of the dish. Growth of cells on C2, collagen, and E1 revealed a similar pattern and a reduction in the doubling time compared with cells grown on uncoated dishes. C2 had a mass of 2.046 kDa with 22 residues, and sequence analysis revealed a higher percentage occurrence of hydrophilic residues compared with other regions in collagen. Docking studies revealed GDDGEA in C2 as the probable site of interaction with integrins α2β1 and α1β1, and stability studies proved C2 to be mostly protease-resistant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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