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Enregistrement W1872883779

Molecular prenatal diagnosis of a sporadic alobar holoprosencephalic fetus: genotype-phenotype correlations.

2012· article· en· W1872883779 sur OpenAlexaff
Jean Gekas, Consolato Sergi, Deepak Kamnasaran

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensHôpital Saint-François d'Assise
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHoloprosencephalyGeneticsExonPenetranceBiologyPrenatal diagnosisPhenotypeGeneFetus
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: holoprosencephaly is the most common forebrain malformation syndrome with a multifactorial etiology. Currently, mutations are identified in 5-10% of non syndromic, non-chromosomal cases in at least 12 genes. We report the molecular prenatal diagnosis of a fetus with alobar holoprosencephaly. METHODS: CTG band karyotyping and array CGH genome-wide cytogenetic screenings were done, in conjunction with DNA sequence analyses of the SHH, ZIC2, SIX3 and TGIF genes in search of a molecular etiology and with comparison of findings to prior cases. RESULTS: standard CTG band karyotyping and array CGH genome-wide screening failed to identify plausible chromosome imbalances or structural anomalies. However, extensive sequencing of the genomic DNA from the fetus and both parents on all exon and exon-intron boundaries of the four most commonly mutated genes: SHH, ZIC2, SIX3 and TGIF, identified codon 100 of the sonic hedgehog (SHH) gene having a hotspot for loss-of-function mutations in our case and others. CONCLUSION: mutations in codon 100 of SHH were discovered in both sporadic and autosomal dominant inherited cases with evidence of variable expressivity and penetrance. Collectively, this study reinforces the complexity of genotype-phenotype correlations in the prenatal diagnosis of holoprosencephalic fetuses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,451
Score d'incertitude au seuil0,676

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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