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A FLUOROMETRIC TECHNIQUE FOR THE IN VITRO MEASUREMENT OF GROWTH AND VIABILITY IN QUAHOG PARASITE UNKNOWN (QPX)

2005· article· en· W1880567501 sur OpenAlexaboutno aff
Deenie M. Buggé, Bassem Allam

Notice bibliographique

RevueJournal of Shellfish Research · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueParasite Biology and Host Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesResearch Foundation for the State University of New YorkNew York Sea Grant, State University of New YorkNational Research FoundationNew York State Department of Environmental ConservationNational Oceanic and Atmospheric AdministrationU.S. Department of Commerce
Mots-clésParasite hostingBiologyMercenariaIn vitroPathogenZoologyVirulenceRange (aeronautics)IncubationProtozoan parasiteMicrobiologyEcologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quahog parasite unknown (QPX) is a protistan parasite that causes significant mortalities among hard clams, Mercenaria mercenaria, in the northeastern United States and Canada. This pathogen has been successfully isolated from clams from different geographic locations, and in vitro cultures are being used in investigations of the parasite's genetic makeup, virulence and environmental tolerances. Many of these investigations require an easily reproducible, quantitative method to rapidly measure QPX cell viability and proliferation. Therefore, a fluorometric microplate technique was developed using fluorescein diacetate (FDA) as an indicator of cell viability. The developed technique provides a good estimate of the biovolume of live QPX cells. Fluorescent signals are correlated with the number and the size of individual QPX cells. Optimal experimental conditions included an FDA concentration range of 30–50 μM with an incubation period of 15–30 min in the dark. This FDA assay was used to investigate the dynamics of in vitro growth of QPX. Results showed that the growth dynamic is different among QPX isolates. For instance, exponential growth lasted for 1 week in two QPX isolates cultured from clams collected from New York and Massachusetts; whereas a third isolate (from New York) grew exponentially during 2 weeks under similar experimental conditions. While there are limitations to in vitro studies that must be recognized, research using cultured QPX cells is indispensable and will probably lead to significant progress in our knowledge of the biology and physiology of this parasite.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,416
Score d'incertitude au seuil0,252

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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