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Enregistrement W1881657994 · doi:10.1002/jms.2991

Dereplication of known pregnane glycosides and structural characterization of novel pregnanes in <i>Marsdenia tenacissima</i> by high‐performance liquid chromatography and electrospray ionization‐tandem mass spectrometry

2012· article· en· W1881657994 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Mass Spectrometry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiquePhytochemistry and Bioactive Compounds
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesSouthwest University for Nationalities
Mots-clésChemistryPregnaneElectrospray ionizationTandem mass spectrometryGlycosideGlycosylFragmentation (computing)Mass spectrometryChromatographyCollision-induced dissociationIon trapElectrosprayStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the search for novel natural products in plants, particularly those with potential bioactivity, it is important to efficiently distinguish novel compounds from previously isolated, known compounds, a process known as dereplication. In this study, electrospray ionization-multiple stage tandem mass spectrometry (ESI-MS(n)) was used to study the behaviour of 12 pregnane glycosides and genins previously isolated from Marsdenia tenacissima, a traditional Chinese medicinal plant, as a basis for dereplication of compounds in a plant extract. In addition to [M + Na](+) and [M + NH(4)](+) ions, a characteristic [M-glycosyl + H](+) ion was observed in full-scan mode with in-source fragmentation. Sequential in-trap collision-induced dissociation of [M + Na](+) ions from 11,12-diesters revealed consistent preferred losses of substituents first from C-12, then from C-11, followed by losses of monosaccharide fragments from the C-3 tri- and tetrasaccharide substituents. A crude methanol extract of M. tenacissima stems was analysed using high-performance liquid chromatography coupled to ESI-MS. Several previously isolated pregnane glycosides were dereplicated, and the presence of an additional nine novel pregnane glycosides is predicted on the basis of the primary and fragment ions observed, including two with a previously unreported C(4)H(7)O C-11/C-12 substituent of pregnane glycosides. This study is the first report of prediction of the structures of novel pregnane glycosides in a crude plant extract by a combination of in-source fragmentation and in-trap collision-induced dissociation and supports the usefulness of LC-ESI-MS(n) not only for dereplication of active compounds in extracts of medicinal plants but also for detecting the presence of novel related compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,757

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle