MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1881714497 · doi:10.1139/cjc-2012-0504

The reaction mechanism of chiral hydroxylation of <i>p</i>-OH and <i>p</i>-NH<sub>2</sub> substituted compounds by ethylbenzene dehydrogenase

2013· article· en· W1881714497 sur OpenAlexvenueno aff
Agnieszka Dudzik, Bartłomiej Kozik, Mateusz Tataruch, Anna Wójcik‐Augustyn, Daniel Knack, Tomasz Borowski, Johann Heider, M. Witko, Maciej Szaleniec

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Catalysis and Immobilization
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesZentrum für Synthetische MikrobiologieEuropean CommissionFundacja na rzecz Nauki PolskiejEuropean Regional Development FundDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Research Centre
Mots-clésChemistryCarbocationEthylbenzeneDeprotonationSubstituentBiocatalysisEnantiomeric excessReaction mechanismStereochemistryEnantiomerReaction intermediateMedicinal chemistryOrganic chemistryEnantioselective synthesisCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ethylbenzene dehydrogenase (EbDH; enzyme commission (EC) number: 1.17.99.2) is a unique biocatalyst that hydroxylates alkylaromatic and alkylheterocyclic compounds to (S)-secondary alcohols under anaerobic conditions. The enzyme exhibits a high promiscuity catalyzing oxidation of over 30 substrates, inter alia, para-substituted alkylphenols and alkylanilines. Secondary alcohols with OH and NH 2 substituents in the aromatic ring are highly valuable synthons for many biologically active compounds in the fine chemical industry. EbDH hydroxylates most of the studied compounds highly enantioselectively, except for five substrates that harbour OH and NH 2 groups in the para position, which exhibit a significant decrease in the percent enantiomeric excess (% ee). This phenomenon is inconsistent with the previously suggested enzyme mechanism, but it may be linked to a stabilization of the carbocation intermediate by deprotonation of the OH or NH 2 substituent in the active site that yields a transient quinone (imine) ethide species. This would initiate an alternative reaction pathway involving the addition of a water molecule to a C=C double bond. This hypothesis was cross-validated by density functional theory (DFT) cluster modelling of the alternative reaction pathway with 4-ethylphenol, as well as by experimental assessment of the pH dependency of enantiomeric excesses. The results reported herein suggest that the alternative reaction pathway may significantly contribute to the overall reaction if the carbocation intermediates are stabilized by deprotonation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,391

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,177
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of ChemistryMême sujetEnzyme Catalysis and ImmobilizationTravaux en français237 207