Microbial community and potential functional gene diversity involved in anaerobic hydrocarbon degradation and methanogenesis in an oil sands tailings pond
Notice bibliographique
Résumé
Oil sands tailings ponds harbor large amounts of tailings resulting from surface mining of bitumen and consist of water, sand, clays, residual bitumen, and hydrocarbon diluent. Oxygen ingress in these ponds is limited to the surface layers, causing most hydrocarbon degradation to be catalyzed by anaerobic, methanogenic microbial communities. This causes the evolution of large volumes of methane of up to 10(4) m(3)/day. A pyrosequencing survey of 16S rRNA amplicons from 10 samples obtained from different depths indicated the presence of a wide variety of taxa involved in anaerobic hydrocarbon degradation and methanogenesis, including the phyla Proteobacteria, Euryarchaeota, Firmicutes, Actinobacteria, Chloroflexi, and Bacteroidetes. Metagenomic sequencing of DNA isolated from one of these samples indicated a more diverse community than indicated by the 16S rRNA amplicon survey. Both methods indicated the same major phyla to be present. The metagenomic dataset indicated the presence of genes involved in the three stages of anaerobic aromatic hydrocarbon degradation, including genes for enzymes of the peripheral (upper), the central (lower), and the methanogenesis pathways. Upper pathway genes showed broad phylogenetic affiliation (Proteobacteria, Firmicutes, and Actinobacteria), whereas lower pathway genes were mostly affiliated with the Deltaproteobacteria. Genes for both hydrogenotrophic and acetotrophic methanogenesis were also found. The wide variety of taxa involved in initial hydrocarbon degradation through upper pathways may reflect the variety of residual bitumen and diluent components present in the tailings pond.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».