Altering Heparin Cofactor II at VAL439 (P6) either Impairs Inhibition of Thrombin or Confers Elastase Resistance
Notice bibliographique
Résumé
Heparin cofactor II (HCII) is plasma glycoprotein and thrombin inhibitor of the serpin type previously shown to inhibit thrombin in the absence of its N-terminal 74 amino acids, and to be cleaved by neutrophil elastase (NE) at two sites: I66-F67 and V439-G440, the P6-P5 bond of the reactive center loop. We examined the contribution of Val439 to the reaction of HCII with thrombin and NE. Hexahistidine-tagged HCII proteins lacking residues 1-66 (H6delta66HCII) containing either the wild-type Val 439 or one of six substitutions were-expressed in E. coli. The rates of heparin-catalyzed thrombin inhibition of the V439L, C, or R variants were reduced at least 80-fold compared to wild-type H6delta66HCII, while those of the F, S, or W variants were largely unchanged. Following controlled exposure to NE in the presence of heparin, these latter variants retained 3.5- to 4.5-fold more residual anti-thrombin activity than wild-type H6delta66HCII treated in the same manner. This resistance arose due to deflection of NE attack from V439-G440 to secondary sites. The F, S, or W V439 variants exhibited a similar or greater degree of NE resistance when re-expressed as full-length hexahistidine-tagged HCII proteins, suggesting that the I66-F67 NE site is not well recognized in non-glycosylated HCII. Of these full-length variants, the V439F was the most active, exhibiting only a 2-fold reduction in its heparin-catalyzed rate of thrombin inhibition. HCII can therefore be made NE-resistant without severely compromising its capacity to inhibit thrombin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».