<scp>PEFLINS</scp>: A Family of Penta<scp>EF</scp>‐Hand Proteins
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Penta‐EF hand proteins, or PEFLINs, belong to the superfamily of regulatory Ca2+‐binding proteins with EF‐hand motifs. The calcium‐binding domain is ∼170 residues long and contains five EF‐hand motifs, of which only some retain the ability to bind calcium. Within individual molecules the (1st + 2nd) and (3rd + 4th) EF‐hands are associated in pairs while the 5th EF‐hand is unpaired. This domain is associated with an N‐terminal domain of varying length, usually 20 to 100 residues long and with a Gly/Pro‐rich region. Binding of Ca2+promotes association of these proteins with membranes, andin vitroleads to aggregation. On the basis of the 1st EF‐hand, these proteins are divided into two subfamilies. Calpain, grancalcin, and sorcin have a one‐residue deletion in the Ca2+‐binding loop between helices E and F and form a distinct variant of calcium binding. ALG‐2 and peflin have the canonical EF1 hand and bind calcium in a standard way. All penta‐EF hand proteins form homo‐ or heterodimers. The dimerization is promoted by pairing of the 5th EF‐hand of each molecule; thus in the dimer all EF‐hands are paired. Binding of Ca2+promotes only small, mostly local, conformational changes and it is plausible that binding of a concomitant partner molecule is required for larger rearrangements to occur.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».