Immune responses of porcine airway epithelial cells to poly(I:C), a synthetic analogue of viral double-stranded RNA
Notice bibliographique
Résumé
Yang, X.-q., Wang, L., Li, H.-t. and Liu, D. 2015. Immune responses of porcine airway epithelial cells to poly(I:C), a synthetic analogue of viral double-stranded RNA. Can. J. Anim. Sci. 95: 13–20. Swine respiratory disease (SRD) is one of the most economically important diseases affecting the pig industry. The main infectious agents that cause SRD are viruses, but the molecular pathogenesis of viral SRD has not been extensively studied. Here, using digital gene expression tag profiling, the global transcriptional responses to poly(I:C), a synthetic analogue of viral double-stranded RNA, was analyzed in porcine airway epithelial cells (PAECs). The profiling analysis revealed numerous differentially expressed genes (DEGs), including unknown sequences in the porcine nucleotide databases. Gene ontology enrichment analysis showed that DEGs were mainly enriched in response to stress (GO: 0006950), of which, defense response is one sub-process. Poly(I:C) challenge induced a general inflammation response as indicated by marked upregulation of a variety of pathogen recognition receptors, interferon-stimulated genes, proinflammatory cytokines, and chemokines, together with the significant downregulation of anti-inflammatory molecules. Furthermore, the antiapoptotic pathway was triggered, as demonstrated by the significant suppression of molecules involved in the induction of apoptosis, together with the significant stimulation of putative inhibitor of apoptosis. The results indicate that PAECs initiated defense against poly(I:C) challenge through the inflammation responses, whereas poly(I:C) can utilize antiapoptotic pathway to evade host defense.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».