MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1887213179 · doi:10.4141/cjas2013-145

Immune responses of porcine airway epithelial cells to poly(I:C), a synthetic analogue of viral double-stranded RNA

2014· article· en· W1887213179 sur OpenAlexvenueno aff
Xiuqin Yang, Liang Wang, Haitao Li, Di Liu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Animal Science · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésDownregulation and upregulationChemokineBiologyImmune systemInterferonProinflammatory cytokineInflammationRNAGeneMolecular biologyApoptosisGene expression profilingGene expressionCell biologyImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Yang, X.-q., Wang, L., Li, H.-t. and Liu, D. 2015. Immune responses of porcine airway epithelial cells to poly(I:C), a synthetic analogue of viral double-stranded RNA. Can. J. Anim. Sci. 95: 13–20. Swine respiratory disease (SRD) is one of the most economically important diseases affecting the pig industry. The main infectious agents that cause SRD are viruses, but the molecular pathogenesis of viral SRD has not been extensively studied. Here, using digital gene expression tag profiling, the global transcriptional responses to poly(I:C), a synthetic analogue of viral double-stranded RNA, was analyzed in porcine airway epithelial cells (PAECs). The profiling analysis revealed numerous differentially expressed genes (DEGs), including unknown sequences in the porcine nucleotide databases. Gene ontology enrichment analysis showed that DEGs were mainly enriched in response to stress (GO: 0006950), of which, defense response is one sub-process. Poly(I:C) challenge induced a general inflammation response as indicated by marked upregulation of a variety of pathogen recognition receptors, interferon-stimulated genes, proinflammatory cytokines, and chemokines, together with the significant downregulation of anti-inflammatory molecules. Furthermore, the antiapoptotic pathway was triggered, as demonstrated by the significant suppression of molecules involved in the induction of apoptosis, together with the significant stimulation of putative inhibitor of apoptosis. The results indicate that PAECs initiated defense against poly(I:C) challenge through the inflammation responses, whereas poly(I:C) can utilize antiapoptotic pathway to evade host defense.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,335
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of Animal ScienceMême sujetAnimal Virus Infections StudiesTravaux en français237 207