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Enregistrement W1887662634 · doi:10.1139/gen-2013-0218

Detection of new genetic profiles and allelic variants in improperly classified grapevine accessions

2014· article· en· W1887662634 sur OpenAlexvenueno aff
Angelo Gismondi, Stefania Impei, Gabriele Di Marco, Manna Crespan, Donatella Leonardi, Antonella Canini

Notice bibliographique

RevueGenome · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHorticultural and Viticultural Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMicrosatelliteLocus (genetics)CultivarGenotypeAlleleVitis viniferaGenetic diversityHorticultureBotanyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thirty-seven grapevine accessions, collected in Central Italy, were characterized by morphological and genetic analysis, according to guidelines developed by European Union programs of grapevine research and standardization. Traditional denominations of some sampled varieties were revealed to be incorrect; moreover, 10 synonymies and 12 homonymies were recognized. Ampelographic and ampelometric measurements of leaf characters were performed. These data generated a phenotypic similarity matrix and a relative diagram showing morphological differences between specimens. Many samples presented different morphology even in the presence of the same genotype, probably as a result of various environmental pressures. Grapevines were typed by 12 microsatellite loci and then compared with the CRA-VIT genetic resource database. Twenty-five SSR profiles were clearly identified as well-known cultivars, while nine genotypes did not find a direct correspondence: these samples could represent putative new autochthonous Latial Vitis vinifera cultivars or hybrid varieties. The genetic approach also detected three new (169 and 173 in VVMD27 locus; 179 in ISV2 locus) and seven rare allelic variants. Plant sample classification by oral history, morphological observations, and molecular results were compared and discussed. Scions of samples were planted in the Botanic Garden of the University of Rome "Tor Vergata", to preserve grapevine biodiversity and to protect possible new autochthonous varieties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil0,151

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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