Effect of backgrounding and transition diets on fecal concentration and strain types of commensal<i>Escherichia coli</i>in beef cattle
Notice bibliographique
Résumé
Su, R., Munns, K., Beauchemin, K. A., Schwartzkopf-Genswein, K., Jin-Quan, L., Topp, E. and Sharma, R. 2011. Effect of backgrounding and transition diets on fecal concentration and strain types of commensal Escherichia coli in beef cattle. Can. J. Anim. Sci. 91: 449–458. The aim of the study was to assess the effect of four different backgrounding diets [55% corn silage in combination with 40% of either temper rolled barley-grain, wheat dried distillers' grain, corn dried distillers' grain or millrun (dry matter basis)] and a transition diet containing increasing amount of concentrate (60 to 90%) on fecal Escherichia coli in feedlot heifers. Heifers were fed backgrounding forage based diets for 91 d and then were shifted to a transition diet for an additional 18 d. Strain characterization of E. coli (n=224) was carried out at time time points over 109 d and indicated that heifers fed the barley–grain diet shed higher (P<0.001) total and tetracycline-resistant (Tetr) E. coli in the backgrounding phase. Of the total E. coli examined (n=224), 70.3% showed resistance to one or more of the 14 antimicrobials examined, which increased to 82.3% by day 109. Among the recovered E. coli, 23 phenotypes and 154 pulsed field gel electrophoresis patterns grouped into 38 clusters indicative of extensive E. coli diversity in heifers. Although supplementation of 40% barley-grain was correlated to higher total E. coli shedding in the backgrounding phase, the backgrounding diets did not influence strain clustering. Strains collected during the transition phase clustered more closely than those collected during the backgrounding phase. This increased strain clustering with high concentrate inclusion in the transition diet was observed within 18 d of the transition phase. Our study indicated variations in E. coli shedding rates and strain clustering in relation to time and diet.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».