Ergosterol and mycorrhizal fungi – the way forward
Notice bibliographique
Résumé
Ergosterol and fatty acids for biomass estimation of mycorrhizal fungi are discussed in a New Phytologist article by Olsson et al. (2003). The findings indicate that arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) do not contain ergosterol and thus cannot be assessed using an ergosterol assay. This speaks directly to a recent study in which we used ergosterol analysis to estimate living AMF biomass in the root and soil (Hart & Reader, 2002a,b). The results of Olsson et al. suggest that our results do not reflect AMF colonization but rather colonization by nonglomalean fungi. We feel that our results do reflect AMF activity for the following reasons. First, our ergosterol measurements were extremely low in nonAMF treatments, thus it is unlikely that there was a high degree of contamination solely in AMF treatments. Second, our ergosterol measurements were almost perfectly correlated with measures of per cent root length colonization (using uniquely AMF structures) and soil hyphal length (Hart & Reader, 2002b). Finally, because our results showed high ergosterol in roots for the Glomaceae and high ergosterol in soil for the Gigasporaceae, the results of Olsson et al. would suggest that contamination in our study mirrored the pattern of AMF colonization. If this were the case, and contaminating fungi were so closely associated with AMF, then ergosterol would still provide a good, if indirect, estimate of AMF activity. Olsson et al. have shown that, in vitro, two AMF isolates contain little ergosterol. In the future, it will be important to examine more isolates and more species. It remains to be seen how ergosterol production is affected by edaphic conditions because monoxenic cultures do not reflect the way in which AMF behave under natural conditions. More work needs to be done to discover the true origin of ergosterol in such studies. Is the ergosterol contaminant in origin and, if so, how is it so closely linked to AMF colonization? Or do AMF in soil behave very differently to monoxenic cultures?
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,007 |
| Communication savante | 0,007 | 0,033 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,014 | 0,018 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,006 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».