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Enregistrement W1890228674 · doi:10.5376/mp.2011.02.0005

Cloning and Prokaryotic Expression of <i>Apple Stem Pitting Virus</i> CP Gene in Ya Pear in <i>E. coli</i>

2011· article· en· W1890228674 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueMolecular Pathogens · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCloning (programming)PEARBiologyGeneMolecular biologyGeneticsHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In order to clarify evolutionary relationship and genetic diversity of apple stem pitting virus (ASPV), and preparation the corresponding special antiserum. In this study, total RNA was extracted from phloem tissue of Ya (Y) pear which infected by ASPV and used as template for cDNA synthesis. The coat protein (CP) gene of ASPV was cloned and sequenced. The CP gene of Ya pear was cloned into expression vector PET-28a, and transformed into E . coli BL21 (DE3), and SDS-PAGE electrophoresis analysis. The results showed that the complete CP gene consisted of 1 194 nucleotides and encodes a polypeptide of 397 amino acid (aa). Comparison of the amino acid sequences of Ya pear CP gene with other ASPV isolates showed approximately 70% similarity. Phylogenetic tree showed that all isolates of the coat protein (CP) genes of ASPV isolates at AA sequence revealed three groups. All ASPV isolates from apple were clustered to group I, whereas pear were clustered to groups â…i (except NC_003462) and the Ya pear were clustered into group â…¢. Results of SDS-PAGE showed that specific expression of a 42 kD fusion protein was achieved by the inducing of 1 mmol/L IPTG. The complete CP gene and prokaryotic expression vector of Ya pear provided additional baseline data for preparation recombinant polyclonal antibody of ASPV and further study of ASPV molecular biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,141
Score d'incertitude au seuil0,983

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle