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Enregistrement W1890549880 · doi:10.1097/pas.0000000000000487

Secretory Breast Carcinoma

2015· article· en· W1890549880 sur OpenAlexaff
Marie Del Castillo, Frédéric Chibon, Laurent Arnould, Sabrina Croce, Agnès Ribeiro, Gaëlle Pérot, Isabelle Hostein, Sameh Geha, Catherine Bozon, Agnès Garnier, Marick Laé, Anne Vincent‐Salomon, Gaëtan MacGrogan

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBreast Lesions and Carcinomas
Établissements canadiensHôpital Fleurimont
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésETV6Fluorescence in situ hybridizationBiologyComparative genomic hybridizationGene duplicationGene rearrangementFusion geneNuclear atypiaMolecular biologyChromosomal translocationPathologyImmunohistochemistryGeneticsChromosomeGeneMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Secretory breast carcinoma (SBC) is a rare breast carcinoma with distinctive morphologic features and a recurrent specific chromosomal translocation t(12;15)(p13;q25), usually of low histologic grade and favorable prognosis. We describe the morphologic and genetic characteristics of 11 cases of SBC from 10 patients. Histologic and immunohistochemical analyses, fluorescence in situ hybridization using break-apart probes specific to ETV6 on 12p13, reverse transcription polymerase chain reaction with in-house probes specific to the ETV6-NTRK3 gene fusion, and DNA copy number variation by array comparative genomic hybridization analyses were performed on all cases. Seven cases were of low histologic grade, 3 were intermediate, and 1 had high-grade nuclear atypia, necrosis, and numerous mitoses. This patient had a fatal outcome. Five cases displayed low hormonal receptor expression, whereas the rest had basal-type immunoprofiles. All interpretable cases harbored an ETV6-NTRK3 gene fusion by reverse transcription polymerase chain reaction and/or an ETV6 rearrangement by fluorescence in situ hybridization, with duplication of the oncogenic derivative in 2 cases. Array comparative genomic hybridization analysis showed simplex genomic profiles. The 2 cases with ETV6-NTRK3 duplication included a gain of 12p starting from the ETV6 locus to the telomere, associated with a gain of the 15q from the centromere to NTRK3 in 1 case, and in the other a normal profile up to NTRK3 on 15q, and then a loss up to the telomere, suggesting loss of corresponding normal chromosome 15. These findings provide a novel insight into the morphologic and genetic spectrum of SBC, ranging from low-grade to high-grade histology, with occasional low hormonal receptor expression, simplex genomic profiles, and possible unfavorable course.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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