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Enregistrement W1892310923 · doi:10.1139/cjm-2014-0239

Simultaneous overexpression of multidrug efflux pumps in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> non-cystic fibrosis clinical isolates

2014· article· en· W1892310923 sur OpenAlexvenueno aff
Kanchana Poonsuk, Chanwit Tribuddharat, Rungtip Chuanchuen

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRoyal Golden Jubilee (RGJ) Ph.D. ProgrammeThailand Research FundChulalongkorn University
Mots-clésPseudomonas aeruginosaEffluxBiologyMicrobiologyMultiple drug resistanceCystic fibrosisAntibioticsDrug resistanceAntibiotic resistanceGenePhenotypeBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The purpose of this study was to examine expression and regulation of 6 multidrug efflux systems, including MexAB-OprM, MexCD-OprJ, MexEF-OprN, MexXY, MexJK, and MexVW, in 13 non-cystic fibrosis (CF) clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa. These isolates displayed a high level of resistance to many clinically important antibiotics. Some isolates simultaneously overexpressed up to 4 different Mex systems, as determined by quantitative real-time reverse transcription PCR. None of the isolates overexpressed MexCD-OprJ, and only 1 isolate overproduced MexJK. All the isolates overexpressed MexXY, while overexpression of MexEF-OprN and MexVW was common. DNA sequencing analysis of regulatory genes showed that no clear correlation could be established among (i) the presence of mutations, (ii) the type of mutations, (iii) the expression level of the Mex systems, and (iv) resistance to antibiotic substrates. The results suggest that the concomitant overexpression of some Mex systems may superimpose their antimicrobial drug efflux capabilities, contributing to the multidrug resistance phenotype in the P. aeruginosa non-CF clinical isolates. The existence of uncharacterized regulators for the Mex systems was signified.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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