Alternative Forms of Formamidopyrimidine-DNA Glycosylase from Arabidopsis thaliana¶
Notice bibliographique
Résumé
Formamidopyrimidine-DNA glycosylase (FPG) catalyzes the initial steps in the repair of DNA containing oxidized purines. Two complementary DNA clones encoding homologs of bacterial FPG, designated Atfpg-1 and Atfpg-2, have been isolated from Arabidopsis thaliana. They are products of alternative splicing of the transcript of a single gene. Proteins encoded by both clones, AtFPG-1 and AtFPG-2, engineered to contain oligohistidine sequences on their C-terminal ends, were expressed in Escherichia coli and purified, and their activities were assayed. Both proteins cleaved DNA that contained apurinic sites, indicating that they have abasic lyase activity. AtFPG-1, but not AtFPG-2, showed significant cleavage of a double-stranded oligonucleotide that contained 8-oxo-guanine, indicating that the structural differences between the two proteins influence their enzymatic activities. However, both proteins were able to cleave the same sites in DNA that was treated with visible light in the presence of methylene blue.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».