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Enregistrement W1893462693 · doi:10.1139/cjm-2013-0027

Occurrence and population density of <i>Campylobacter jejuni</i> in irrigation ponds on produce farms in the Suwannee River Watershed

2013· article· en· W1893462693 sur OpenAlexvenueno aff
Ganyu Gu, Zhiyao Luo, Juan Manuel Cevallos‐Cevallos, Paige Adams, George Vellidis, Anita C. Wright, A.H.C. van Bruggen

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCampylobacter jejuniCampylobacterIrrigationPopulationFecesVeterinary medicineAnimal sciencePopulation densityBiologyFecal coliformLimitingEnvironmental scienceEcologyBacteriaWater qualityMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campylobacter spp., especially Campylobacter jejuni, are common causal agents of gastroenteritis globally. Poultry, contaminated water, and fresh produce are considered to be the main sources for infection by this pathogen. In this study, occurrence and population density of C. jejuni from vegetable irrigation ponds in the Suwannee River watershed were investigated and the relationship to environmental factors was analyzed. Two water samples were collected from each of 10 ponds every month from January 2011 to February 2012. Campylobacter jejuni was detected by quantitative real-time PCR. Nine of the 10 ponds were positive for C. jejuni some of the time with an overall prevalence of 19.3%. The highest counts were obtained in spring 2011. Oxidation-reduction potential and total nitrogen concentration were positively correlated (P < 0.05) with mean population and occurrence of C. jejuni, while temperature and dissolved oxygen percent saturation (DO%) were negatively correlated with mean population (P < 0.05). Presence of this pathogen was related to bacterial community composition. No correlations were found between C. jejuni and fecal indicators. Increasing DO% of irrigation water and limiting nitrogen pollution in the ponds are suggested to reduce the contamination risk of C. jejuni in a major fruit and vegetable growing area.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,085

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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