Utilization of target enriched multiplex PCR for detection of panton-valentine leukocidin in necrotizing pneumonia complicating influenza A
Notice bibliographique
Résumé
Necrotizing pneumonia caused by Staphylococcus aureus (SA) is a complication of Influenza A (INFA) related to the SA virulence factor, Panton-Valentine leukocidin (PVL). Patients presenting with Influenza-like illness and respiratory failure underwent bronchoscopy and testing for viral respiratory pathogens and SA using Diatherix target enriched multiplex PCR (Tem-PCR) proprietary assay. The assay is nested PCR, with tagged, target specific primers providing initial target gene identification, and common flanking Super Primers providing bulk amplification. Two patients with SA PVL necrotizing pneumonia complicating INFA are described. 22 yo female presented with respiratory failure, SA-PVL bacteremia and septic shock. Bronchoscopy revealed necrotizing, hemorrhagic pneumonia with specimens positive by Tem-PCR for INFA H3N2 and PVL positive SA. Patient eventually died. 64 yo male presented with progressive shortness of breath after viral illness, rapidly developed septic shock and multiorgan failure. Bronchoscopy showed severe necrotizing hemorrhagic tracheobronchitis. Tem-PCR revealed INFA H1N109 and methicillin resistant PVL positive SA. Patient was successfully treated with linezolid and clindamycin with complete recovery. PVL is a cytotoxin causing leukocyte destruction, tissue necrosis precipitating shock, respiratory failure and leukopenia. Bronchoscopy reveals airway bleeding and acute inflammatory exudate. PVL-producing strains of SA have affinity for exposed basement membrane in the ciliary epithelium of the lung present after viral illness. Tem-PCR is unique technology detecting PVL-positive SA and INFA resulting in targeted therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».