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Enregistrement W1896577038 · doi:10.4049/jimmunol.179.12.8341

Interactions between <i>Idd5.1/Ctla4</i> and Other Type 1 Diabetes Genes

2007· article· en· W1896577038 sur OpenAlexaff
Kara Hunter, Dan Rainbow, Vincent Plagnol, John A. Todd, Laurence B. Peterson, Linda S. Wicker

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDiabetes and associated disorders
Établissements canadiensJuvenile Diabetes Research Foundation
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesWellcome Trust
Mots-clésAlleleGeneticsBiologyGeneSingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two loci, Idd5.1 and Idd5.2, that determine susceptibility to type 1 diabetes (T1D) in the NOD mouse are on chromosome 1. Idd5.1 is likely accounted for by a synonymous single nucleotide polymorphism in exon 2 of Ctla4: the B10-derived T1D-resistant allele increases the expression of the ligand-independent isoform of CTLA-4 (liCTLA-4), a molecule that mediates negative signaling in T cells. Idd5.2 is probably Nramp1 (Slc11a1), which encodes a phagosomal membrane protein that is a metal efflux pump and is important for host defense and Ag presentation. In this study, two additional loci, Idd5.3 and Idd5.4, have been defined to 3.553 and 78 Mb regions, respectively, on linked regions of chromosome 1. The most striking findings, however, concern the evidence we have obtained for strong interactions between these four disease loci that help explain the association of human CTLA4 with T1D. In the presence of a susceptibility allele at Idd5.4, the CTLA-4 resistance allele causes an 80% reduction in T1D, whereas in the presence of a protective allele at Idd5.4, the effects of the resistance allele at Ctla4 are modest or, as in the case in which resistance alleles at Idd5.2 and Idd5.3 are present, completely masked. This masking of CTLA-4 alleles by different genetic backgrounds provides an explanation for our observation that the human CTLA-4 gene is only associated with T1D in the subgroup of human T1D patients with anti-thyroid autoimmunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,522
Score d'incertitude au seuil0,200

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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