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Enregistrement W1897639738 · doi:10.1111/j.1755-0998.2011.03016.x

Molecular detection of trophic links in a complex insect host–parasitoid food web

2011· article· en· W1897639738 sur OpenAlexaff
Jan Hrček, Scott E. Miller, Donаld L. J. Quicke, M. Alex Smith

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology Resources · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyParasitoidTrophic levelHost (biology)InsectFood webEcologyZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previously, host-parasitoid links have been unveiled almost exclusively by time-intensive rearing, while molecular methods were used only in simple agricultural host-parasitoid systems in the form of species-specific primers. Here, we present a general method for the molecular detection of these links applied to a complex caterpillar-parasitoid food web from tropical rainforest of Papua New Guinea. We DNA barcoded hosts, parasitoids and their tissue remnants and matched the sequences to our extensive library of local species. We were thus able to match 87% of host sequences and 36% of parasitoid sequences to species and infer subfamily or family in almost all cases. Our analysis affirmed 93 hitherto unknown trophic links between 37 host species from a wide range of Lepidoptera families and 46 parasitoid species from Hymenoptera and Diptera by identifying DNA sequences for both the host and the parasitoid involved in the interaction. Molecular detection proved especially useful in cases where distinguishing host species in caterpillar stage was difficult morphologically, or when the caterpillar died during rearing. We have even detected a case of extreme parasitoid specialization in a pair of Choreutis species that do not differ in caterpillar morphology and ecology. Using the molecular approach outlined here leads to better understanding of parasitoid host specificity, opens new possibilities for rapid surveys of food web structure and allows inference of species associations not already anticipated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,802
Score d'incertitude au seuil0,540

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,152 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations123
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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