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Enregistrement W1898015186 · doi:10.1093/genetics/157.4.1543

Novel Role for a <i>Saccharomyces cerevisiae</i> Nucleoporin, Nup170p, in Chromosome Segregation

2001· article· en· W1898015186 sur OpenAlexaff
Oliver Kerscher, Philip Hieter, Mark Winey, Munira A. Basrai

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer Institute
Mots-clésKinetochoreBiologyGeneticsNucleoporinSaccharomyces cerevisiaeChromosome segregationMutantSynthetic lethalityGeneChromosomeNuclear proteinTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We determined that a mutation in the nucleoporin gene NUP170 leads to defects in chromosome transmission fidelity (ctf) and kinetochore integrity in Saccharomyces cerevisiae. A ctf mutant strain, termed s141, shows a transcription readthrough phenotype and stabilizes a dicentric chromosome fragment in two assays for kinetochore integrity. Previously, these assays led to the identification of two essential kinetochore components, Ctf13p and Ctf14p. Thus, s141 represents another ctf mutant involved in the maintenance of kinetochore integrity. We cloned and mapped the gene complementing the ctf mutation of s141 and showed that it is identical to the S. cerevisiae NUP170 gene. A deletion strain of NUP170 (nup170 Delta::HIS3) has a Ctf(-) phenotype similar to the s141 mutant (nup170-141) and also exhibits a kinetochore integrity defect. We identified a second nucleoporin, NUP157, a homologue of NUP170, as a suppressor of the Ctf(-) phenotype of nup170-141 and nup170 Delta::HIS3 strains. However, a deletion of NUP157 or several other nucleoporins did not affect chromosome segregation. Our data suggest that NUP170 encodes a specialized nucleoporin with a unique role in chromosome segregation and possibly kinetochore function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,285
Score d'incertitude au seuil0,523

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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